1998년 안양시 농촌지도소 2층짜리 건물을 통째로 인수하면서 30년 셋방살이를 청산하게 된다. 1층에는 원장실과 사무국을 두고, 2층에는 문화강좌 교실을 만들어 문화강좌를 계속 이어나갔다. 또한, 향토문화 연구 사업을 활성화하기 위해 한국문화원연합회의 공문에 따라 2000년에 향토문화연구소가 설립되었다. 이때부터 향토사연구소에서 연구 업무와 편찬 업무를 총괄하며 『안양시 교육 총람』, 『향토체육사』, 『안양의 민속놀이와 세시 풍속』, 『안양집성촌 자료집』, 『안양의 종교 총람』, 『안양의 금석문』 등을 발간하였다. 그리고 현재 산하단체인 ‘안양문화유산해설사회’의 전신인 ‘안양시 문화재 길라잡이’가 결성되었고, 안양시 문화재 홍보 및 해설을 위한 전문성을 높이기 위해 소양 교육과 자체적 답사, 토론회를 가지며 타 문화원의 벤치마킹이 되었다고 한다.

2003년 장석재 원장이 취임하며 현재의 시스템으로 변화를 이룬다. 당시 문화원은 사업비에서 시 예산의 10%를 자체자금으로 충당하게 하였는데, 열악한 재정을 확충하기 위해 후원금을 유치하는 한편 임원 분담금 및 부원장 5인 체제, 문화가족 제도를 만들어 2004년 지방문화원 관리운영평가에서 ‘자치단체의 재정력에 비해 적은 지원에도 불구하고 적극적인 사업 추진으로 일정한 성과를 거두고 있는 모범 문화원, 노력하는 문화원’으로 평가받아 A등급을 받기도 하였다. 또한, 문화원 뒤쪽 마당에 조립식 샌드위치 패널로 가건물을 만들어 사무실을 이전하고 1층 사무국 자리는 전시장으로 활용하여 지역문화예술인들의 창작 활동을 북돋웠으며, 구서이면사무소와 함께 문화원 뒤뜰에 전통가옥 모형을 만들어 실제 전통혼례와 전통문화 체험 학습을 진행하여 고유의 풍속을 이어나갔다. 그리고 ‘청소년 문화탐구단’을 조직하여 향토에 대한 애향심과 문화시민으로서 성장할 수 있도록 정기 답사와 청소년 문화프로그램을 운영하였으며, ‘실버문화학교 어린이 전통문화 어르신 보조 강사 육성 프로그램’으로 조손간의 문화벨트를 형성하며 세대 간의 지역문화 전승에도 힘을 기울였다.